ABC輸送体は、高度に保存されたATP結合部位を持つタンパク質スーパーファミリーで、がん細胞の多剤耐性の原因となるP-糖タンパク質をはじめ、薬物の排出やペプチドの分泌、またアミノ酸などの取り込みに関与する多数の輸送体が知られる。嚢胞性線維症の原因遺伝子CFTRの産物も、構造的にはここに含まれるが塩素イオンチャネルとして働いている。
タンパク質の分泌に関与するSec系などのタンパク質複合体も、ATPをエネルギー源とする能動輸送体である。 また、バクテリオロドプシン、光合成の反応中心、あるいはミトコンドリア・葉緑体の電子伝達系では、それぞれ光エネルギー、酸化還元反応で得られるエネルギーにより、膜の一方から他方へプロトンが移動し（この濃度差が結果的にATP合成のエネルギー源となる）、これらも（広義の）プロトンポンプと呼ばれる。 他に、化合物の細胞内への取り込みとそれを基質とする結合反応とを共役させて行う酵素タンパク質がある。例としては、糖の取り込みと共役したリン酸化、アミノ酸の取り込みと共役したγ-グルタミルアミノ酸合成（これらはグループ転移：Group translocationと呼ばれる）や、脂肪酸の取り込みと共役した補酵素A結合反応がある。
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二次性能動輸送を司る輸送体は、キャリアー（運搬体）とも呼ばれる。膜の両側の電気化学ポテンシャル差、すなわち濃度勾配とイオンによる電位差をエネルギー源として物質を輸送する。このエネルギー源として原核生物ではプロトンが、真核生物ではナトリウムイオンが使われる例が多い。酵素と同じ速度論的性質（ミカエリス・メンテン式）を示すので、基質を結合した中間体を経て輸送するものと考えられる。そのため、（正確には酵素ではないが）透過酵素またはパーミアーゼとも呼ばれる。